A América Latina abriga um ambiente único e uma diversidade inexplorada
A América Latina representa um modelo de estudo único dada a heterogeneidade e mistura entre fontes indígenas e outras fontes continentais que contribuem para a população atual.
Esta ancestralidade está sub-representada nas pesquisas atuais e pode abrigar padrões de expressão específicos da população não descobertos no nível celular.
As populações latino-americanas são muito diversas e subestruturadas localmente, não apenas no seu grau de mistura continental, mas também nos seus componentes genéticos subcontinentais.
Um mapa de células humanas da diversidade na América Latina
A América Latina é uma das regiões mais ricas do mundo em termos de diversidade étnica e mistura genética entre povos indígenas e outros ancestrais continentais. Esses ancestrais têm sido sub-representados em estudos de genômica e transcriptômica e podem abrigar padrões de expressão específicos da população não descobertos no nível celular. Sem uma caracterização de alta resolução das populações latino-americanas pouco estudadas, o desenvolvimento de estratégias de medicina de precisão na região será limitado e as disparidades na saúde serão perpetuadas.
Para resolver esse desequilíbrio, esta rede visa construir um mapa celular latino-americano de células sanguíneas imunológicas e tipos de células do tecido da vesícula biliar de diversas populações indígenas e mistas de sete países das Américas (México, Colômbia, Peru, Chile, Brasil e latinos dos EUA). . ). Esses conjuntos de dados serão usados para identificar perfis de RNA específicos de ancestralidade em perfis regulatórios cis e para complementar dados de coorte de doenças relevantes para a epidemiologia local das comunidades participantes.
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Criar uma nova Biorede para o Human Cell Atlas centrada na vesícula biliarInicialmente, serão coletadas amostras de vesícula biliar de diferentes grupos étnicos do Chile por meio de colecistectomias profiláticas, com o objetivo de gerar um mapa completo de células saudáveis da vesícula biliar.
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Criar perfis de expressão de RNAs unicelulares de diferentes tipos de células imunológicas em populações latino-americanasGerar um mapa abrangente de expressão gênica de células imunológicas do sangue de diversas populações nativas e de ascendência mista na América Latina, criado por meio da análise de amostras de sangue periférico de diversas populações.
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Criar um portal comunitário latino-americano para informação, capacitação, intercâmbio, análise e visualização de dados de genômica unicelular.O portal proposto cobrirá diferentes audiências e aspectos da comunicação, participação e capacitação científica, baseando-se em conjuntos de dados scRNA-seq da América Latina criados durante este projeto. Também contará com uma seção para análise de dados através de um servidor web fácil de usar, facilitando a escalabilidade e confiabilidade dos fluxos de trabalho de análise de dados.
Resultados da pesquisa compartilhados com as comunidades participantes e a sociedade
LatinCells gerará constantemente materiais educacionais e de treinamento relacionados à genômica unicelular e análise de dados. Esses materiais incluem pipelines computacionais, diretrizes de treinamento e outros recursos para analisar, explorar e disseminar o conhecimento e os resultados gerados por nossa iniciativa.
Principais pesquisadores
Conseguimos montar uma equipe formada 100% por latino-americanos, com diversas especialidades relacionadas a:participação comunitária e amostragem;processamento de amostras e biologia celular;análise de dados e bioinformática; eeducação tecnológica avançada.
Andrés Moreno-Estrada,Médico, Doutorado
Cinvestav
México
Carla Gallo, MSc
Universidade Cayetano Heredia
Peru
Carlos Ortiz-Ramirez, PhD
Cinvestav
México
Daniela Robles-Espinoza, PhD
UNAM
México
Guilherme Barreto, PhD
Universidade do Vale
Colômbia
Hugo Guerrero-Cazares, MD, PhD
Mayo Clinic
Estados Unidos
Lúcia Spangenberg, PhD
Instituto Pasteur de Montevideo
Uruguai
Patrícia A. Possik, PhD
Instituto Nacional do Câncer
Brasil
Patrícia Severino, PhD
Hospital Albert Einstein
Brasil
Ricardo Verdudo,PhD
Universidad de Talca
Chile
Vinicius Maracaja-Coutinho, Ph.D.
Universidade do Chile
Chile
A iniciativa LatinCells é financiada pelaIniciativa Chan Zuckerberg (CZI), através do programa“Redes de Ancestrais para o Atlas de Células Humanas”.
Este programa CZI apoia pesquisadores no fornecimento de dados de referência de células únicas saudáveis, de amostras de tecidos ancestralmente diversas para Atlas de células humanas, com o objetivo de criar um recurso mais representativo globalmente para a compreensão da saúde e das doenças humanas.